- 课题研究背景
蛋白质是生命活动的主要承担者,没有蛋白质就没有生命。然而,蛋白质功能的发挥
不是凭借单个蛋白质独立执行的,而是依靠蛋白质与蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI) 执行其功能。近年来,随着酵母双杂交、基于质谱的串联亲和纯化等高通量实验技术的发展,人们得到了越来越多的蛋白质相互作用数据,形成了蛋白质相互作用网络。基于蛋白质相互作用网络的蛋白质功能预测己经成为生物信息学中最重要的研究课题之一。
- 课题研究意义
1、蛋白质功能预测可以有效地帮助生物学家确定蛋白质的功能范畴,以便于生物学家有针对性地设计实验,快速确定蛋白质的功能。
2、蛋白质功能预测与实验测定相辅相成,从而节省大量成本。
3、疾病的引起与蛋白质有关,对蛋白质功能的研究可以用来选择药物靶点,从而进行药物设计。
三、拟解决的问题
1、由于现在大部分的蛋白质相互作用数据都是通过高通量实验获得的,存在大量假阳性和假阴性数据。
2、目前,大约只有1%的蛋白质序列的功能是已知的,由于知道的信息太少,存在已标注数据不足的问题。
四、研究主要内容
1、从已有的蛋白质相互作用数据库获取需要的数据。
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