课题名称 中药网络药理学计算平台搭建及其应用研究课题性质 基础研究 应用课题 设计型 调研综述 理论研究一、 课题研究背景网络药理学是基于系统生物学的理论，对生物系统的网络分析，选取特定信号节点进行多靶点药物分子设计的新学科。
网络药理学强调对信号通路的多途径调节，提高药物的治疗效果，降低毒副作用，从而提高新药临床试验的成功率，节省药物的研发费用。
中药网络药理学的核心研究理念不同于传统的单一靶标，单一药物， 而是多靶标，多成分药物。
网络靶标的基本思想是试图将疾病特异性的分子网络作为药物作用靶点以更好的治疗疾病，建立疾病与中药方剂在分子网络上的关联。
随着中药网络药理学的发展，诞生了一大批相关算法，比如：基于种子药物预测所研究药物的靶点基因的DrugCIPHER，基于疾病表型信息和已知疾病基因关系信息的疾病致病基因预测方法CIPHER，基于基因网络鉴定中药组分的协同作用的NIMS等。
王旭等人在Galaxy平台的基础之上开发了一套中药网络药理学计算平台，但该平台尚存在一系列问题，因此将这些算法集成于一个公共平台将更加有利于科研人员使用。
二、 课题研究意义集成算法的意义在于：（1）整合不同的编程语言运行环境，消除因编程语言引起的算法使用障碍；比如目前王旭等人基于Galaxy创建的中药网络药理学计算平台中的DrugCIPHER算法分三部分组成:输入、计算、输出，考虑到数据导入和结果处理的方便，三部分分别使用了Perl、MATLAB和Ruby实现，在Galaxy平台上或多或少会涉及到命令行操作，这对不熟悉Linux系统的科研人员来说构成了语言障碍，因此有必要屏蔽掉底层的命令界面，给科研人员提供更友善的用户界面。
（2）用更大规模数据检验平台上算法的鲁棒性；GIFT诞生于2015年，NIMS诞生于2011年，DrugCIPHER诞生于2010年，CIPHER则更早到2008年。
这期间各种算法的数据源都有相应的变化，因此有必要使用新数据集检验算法有效性并提供科研人员随时使用方法的能力。
（3）实现计算流程化。
以上是毕业论文文献综述，课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。
