Cucurbit[n]uril(CB[n])作为一种大环化合物,因其独特的空腔结构和优异的分子识别能力,在药物传递领域受到广泛关注。
近年来,计算机模拟技术,特别是分子动力学模拟,为研究CB[n]与小分子药物的相互作用提供了强大的工具,能够在分子水平上揭示药物与载体的结合模式、结合强度、释放机制等关键信息。
本文综述了CB[n]载体与小分子药物结合的计算机模拟研究进展,首先介绍了CB[n]的结构特点、分子识别机制以及分子动力学模拟的基本原理,随后重点概述了近年来该领域的主要研究方法,包括分子对接、分子动力学模拟、自由能计算等,并对相关研究成果进行了评述,例如不同尺寸CB[n]对药物包封能力的影响、溶剂环境对药物-载体复合物稳定性的影响等。
最后,展望了CB[n]载体与小分子药物结合的计算机模拟研究方向,包括开发更精确的模拟方法、构建更复杂的模拟体系以及拓展其在药物设计中的应用等。
关键词:Cucurbit[n]uril;小分子药物;计算机模拟;分子动力学模拟;药物传递
近年来,随着计算化学和计算机技术的迅速发展,计算机模拟技术,特别是分子动力学(MD)模拟,在药物传递领域得到了越来越广泛的应用[1-3]。
MD模拟能够在原子水平上模拟药物分子与载体材料之间的相互作用,为深入理解药物传递机制、优化药物传递系统的设计提供了强有力的工具。
Cucurbit[n]uril(CB[n])是一类由甘脲单元通过亚甲基桥连接而成的桶状大环化合物,其独特的空腔结构和优异的分子识别能力使其成为理想的药物载体材料[4-7]。
CB[n]能够通过主客体相互作用包封各种小分子药物,提高药物的溶解度、稳定性和生物利用度,并实现药物的靶向递送和控释[8-10]。
CB[n]与小分子药物的结合是受多种因素影响的复杂过程,包括CB[n]的空腔尺寸、药物分子的结构和性质、溶剂环境等[11-13]。
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